Recifes de coral, um dos ecossistemas mais diversos do mundo, enfrentam ameaças crescentes que põem em perigo muitos habitantes. Pressões humanas e ambientais afetam distribuição e condição dos recifes. Ameaças variam em significância: de alterar ambiente natural do recife a destruí-lo completamente. Como muitos animais dependem dos recifes para alimento e abrigo, ameaças ambientais crescentes afetam tanto recifes quanto inúmeras espécies marinhas.
Desde início da indústria humana, níveis globais de CO₂ aumentam a cada década. Oceanos cobrem maior parte do planeta e atuam como esponjas absorvendo CO₂ significativo. CO₂ aumentado na água do mar diminui inherentemente o pH dos oceanos. Acidez aumentada afeta ecologia local dos recifes, alterando ambiente marinho ideal para muitas espécies. Pesquisas mostram que níveis elevados de CO₂ reduzem capacidade de formação de conchas dos organismos.
Uma das principais causas de perda de recifes. Plataformas de petróleo, fábricas costeiras e contaminação por pesticidas envenenam coral e vida marinha no recife. Químicos artificiais fluem por rios e são despejados nos oceanos. Contaminantes frequentemente fatais para muitas espécies nos recifes. Com tempo, recifes degradam e morrem; animais que dependem deles para abrigo lutam para sobreviver.
Oceano rende colheita farta para pesca moderna. Porém, muitas práticas são destrutivas ao ambiente do recife.
Níveis elevados de clorofluorcarbonos (CFCs), por práticas industriais, depletaram camada de ozônio em várias partes do mundo. Sem essa barreira natural para absorver a maioria dos raios UV nocivos do sol, radiação intensa pode danificar recifes. Para recifes em águas rasas, luz solar intensa pode danificar significativamente coral ao longo do tempo. Radiação excessiva pode levar à morte do coral, danificando inerentemente população animal local.